目前，国际供应链金融市场还没有统一规范的“游戏规则”及相应的监管体系，各个银行和物流企业在提供供应链金融服务时有不同的单证，不同的合同条款，不同的解释。这就造成了在实践中，一旦在供应链金融服务的整个流程中出现纠纷和风险，很难有相应的法律法规明确银行、第三方物流企业、被授信或融资企业的权利责任和免责。因此，全球化供应链金融的风险管理非常重要。
参与全球化供应链金融的各个主体均面临一定的风险，且风险类型各异。对于从事国际物流的第三方物流企业而言，其参与全球化供应链金融的风险来源广泛。
自身风险大部分源自于企业内部管理的缺陷以及员工操作的失误。对于第三方物流企业而言，主要表现为货物的错发错送、单据制作错误、装卸事故、交通事故等。
来自银行方面的风险包括主观转移风险和客观风险。前者是指银行工作人员的疏忽、过失乃至故意导致的风险，后者是指银行业务流程中固有的潜在风险。
按照目前的供应链金融产品的要求，出质人通常是货物的所有权人。来自货物所有权的风险可以分为系统风险和非系统风险。前者是货物贸易的市场风险，后者是货主企业自我管理缺陷所引致的风险。
质物风险是第三方物流企业所控制的货物自身的风险，包括货物自然属性风险和社会属性风险。前者是货物的自身性质所带来的财产价值的不确定性，后者则是人为因素造成的。
环境风险是供应链金融各方共同面临的，包括三个方面：自然环境风险、人文环境风险和其他。
具体而言，从事国际物流的第三方物流企业在全球化供应链金融业务中主要承担监管的责任，其中会遇到各种各样的内外部风险，主要包括市场风险、信用风险、操作风险、道德风险、内部管理风险、运营风险、环境风险和法律风险等。
1.市场风险
银行等专门的金融企业在提供物流融资服务中，通常选择市场畅销，价格波动小，变现较好、处于正常贸易流转状态下容易储藏保管产品作为质押监管标的物。尽管如此，主要针对库存金融监管标的物的保值能力，金融监管标的物在第三方物流企业监管期间银行必须对其发生的各种损失负责(但银行把此种风险转嫁到了第三方物流企业),因此对各种潜在的安全风险都要加以考虑，还包括对金融监管标的物保存的设施能否有效防止损坏、破坏、变质、自然安全等问题。
2.信用风险
第三方物流企业承担起监管标的物的责任，就要对标的物的数量、保管质量等负责，所以第三方物流企业需要评估融资企业的经营能力和信用状况。如果融资企业的不信用，比如说融资企业的履约能力，或者标的物市场销售环境变化，或者是否是走私物，甚至融资企业存心存在欺诈行为，都有可能给第三方物流企业造成经营风险。
3.操作风险
有些第三方物流企业自身存在管理落后，信息化程度低，从业人员专业能力差等，造成第三方物流企业在实际监管标的物的过程可能产生的操作风险。比如，货物质押的业务中，需要按规定控制标的物的质量、数量，但是货物又处于动态状况下，因此要求第三方物流企业不但要保证标的物的名称、规格型号、材质等属性，还要使标的物的库存数量控制在规定的额度，不能控制物品存量，或者物品出入库时没有控制物品质量，以次充好，都会给第三方物流企业造成风险和损失。
4.道德风险
包括银行工作人员、监管人员、客户带来的风险，诸如银行工作人员与客户、监管人员与客户串通作弊、监管人员监守自盗、客户强行出库等，这些风险可以靠严密的监管体系，各环节相互监督，相互制约。
5.内部管理风险和运营风险
这是企业普遍存在的风险，因缺乏足够的技术支持而引起技术风险，例如价值系统不完善或评估技术不高、网络信息技术落后造成信息不完整、业务不畅以及管理人员的玩忽职守、道德品质等。
6.环境风险
指政策制度和经济环境的改变，合同的条款规定和对金融监管标的物所有权问题涉及法律风险和信用风险。因为政策制度和经济环境的改变由此产生的可能的法律风险和信用风险，包括金融监管标的物的合法性，客户的诚信度。
7.单证风险
目前，我国还没有相关的法律法规统一和规范供应链金融质押的单证，这就造成伪造虚假仓单给第三方物流企业带来的风险。
8.其他风险
目前我国也没有相关的法律法规明确第三方物流企业在物流金融服务中的责任权利与免责。第三方物流企业在实践业务中"代收货款"的法律性也亟待得到行业规范和法律认可，否则一旦出现物流公司代收货款的丢失和抢盗，无法可依，也会存在一定的经营风险。
