对港澳地区的铁路运输按国内运输办理，但又不同于一般的国内运输。货物由内地装车至深圳中转和香港卸车交货，因此，对香港地区的铁路运输是一种特殊的租车方式的两票联运，它的全过程是由国内段铁路运输和港段铁路运输两段组成，由外运公司签发“货物承运收据”。具体来说：货车到达深圳后，要过轨至香港，继续运送到九龙车站。我国铁路与香港铁路不办理直通联运，因此，就形成了现行的这种运输方式。发送地以国内运输向铁路办理托运至深圳北站，收货人为深圳外运公司。深圳外运公司作为各外贸发货单位的代理与铁路办理租车手续，并付给租车费，然后租车去香港。货车过轨后，香港中国旅行社则作为深圳外运公司的代理在港段重新起票托运至九龙。由此可见，对香港地区的铁路运输特点是租车方式两票运输。国内运单不能作为对外结汇的凭证。目前，由各地外运公司以运输承运人的身份向外贸单位提供经深圳中转香港货物的承运货物收据，作为向银行结汇的凭证。京九铁路和沪港直达通车后，内地至香港的运输更为快捷，由于香港特别行政区系自由港，货物在内地和香港间进出，需办理进出口报关手续。对澳门地区的铁路运输，是先将货物运抵广州南站再转船运至澳门。
(一）具体工作
对香港地区的铁路运输是由中国对外贸易运输公司各地分支机构和香港中国旅行社中旅社联合组织。其具体工作是：
1.按照铁路局的规定，按时提出月度要车计划和旬度装车计划；
2.发货地外运公司或外贸进出口公司填制铁路运单向车站办理至深圳北站的托运手续；
3.按车站指定的进货日期，将货物送到车站指定的货位，并办妥出口报关手续；
4.发货单位以出口物资工作单位委托深圳外运分公司办理接货租车过轨等手续，装车后立即拍发起运电报；
5.深圳外运分公司接到各发货地工作单和启动电报后，及时通知中旅社做好接车准备工作；
6.发货地发车后，当地外运分公司与铁路局进行票据交换，并编制货车过轨计划，办理租车手续；
7.货车到达后，深圳外运分公司与铁路局进行票据交换，并编制货车过轨计划，办理租车手续；
8.中旅社向香港海关报关，并向广九铁路公司办理托运起票手续；
9.货到香港后，由中旅社负责卸货并送交货主。如属去澳门货物，则发至广州，由广州外运公司办理中转手续，其他手续与对香港运输货物的手续相同。
(二）港澳运输单证
1.出口物资工作单，这是基本的必备单证之一。它是发货人委托深圳外运分公司和中旅社办理货物转运报关接货等的书面文件，也是被委托人的工作依据和核收运杂费的凭证。
2.出口货物报关单。
3.启运电报。货物装车后24小时内发出。
4.承运货物收据，是结汇收款凭证。
5.根据出口货物性质，有时还要提供商检证书、文物出口证明书、许可证等证件。
(三）供港货物运费计算
由于对香港地区铁路运输是分两段运输的，即国内铁路运输及香港地段的运输，因此，运费是分别按国内铁路运输和香港地段的运输计算的，国内按人民币计算，港段按港币计算。
1.内地段铁路运费的计算。铁路运费是指铁路承运货物时向货主核收的运费。铁路运价分为整车和零担运价。整车运价是用一张运单托运，装入单独—辆车内的货物的运价；零担运价则为用一张运单托运一批数量不足一车的货物的运价。其公式：运价率X计费重量=运费。
2.港段运费按货物性质分为五级，一级最高，五级最低。以计费重量乘以等级运费率即得运费总额。除运费外还要支付装卸费，终点调车费和港段劳务费等。港段运杂费均以港币支付。
