船舶代理人从事的船舶载运货物的出口代理业务主要有办理货物承运、货物中转、安排集装箱的用箱、编制货运计划、缮制各种货运单证、计收运费等。
1.货物承运
船舶代理人代办货物承运的工作内容与船公司自行办理时基本一致，但是，签发装货单的工作通常由船舶代理人来办理。在为出口货物办理出运手续时，船舶代理人应根据班轮船期表、运价本、订舱需要和船公司的指示，从开始签发装货单时起、到截至签发装货单时止，为船公司代办签发装货单的工作，并根据需要办理加载和取消货载的工作。特别是代理承运以FOB条件成交的出口货物时，船舶代理人根据委托方要求，还要将有关货运情况通知出口商，并向委托方告知出口商办理货物出运手续的情况。
2.货物中转
随着集装箱运输的开展、集装箱船舶的大型化，国际海上中转货物越来越多。中转货物在中转港需要办理一系列手续，并完成相关作业。船舶代理人经常会受托代办货物中转业务，并在船舶抵港前根据船期、货运资料，联系安排泊位、卸货和接运等工作；在船舶抵港后及时取得舱单、提单副本和其他随船单证，了解中转货物的情况，办理报关、转运等手续，并制作二程船所需单证；在船舶离港后将有关情况告知委托方和卸货港船公司的代理人。
3.集装箱管理
集装箱管理代理业务是指代理人接受班轮公司的委托，对集装箱及集装箱设备的使用、租用、调运、保管、发放、交接等工作进行管理。
船舶代理人根据出口集装箱清单，获得有关出口集装箱的信息，如出口集装箱的箱号、尺寸、箱型、船名、航次、装港、开航日期、卸港、目的港等。根据已确认接受订舱的集装箱预配清单等单证向订舱人或其代理人发放空箱设备交接单。在出口集装箱装船后，根据港方提供的实际的出口信息，与出口资料进行核对，确保有关集装箱的信息正确。然后根据船公司的要求将出口集装箱清单通过传真、电子邮件等方式传给下港代理人和船公司，并按海关的规定办理出口集装箱的海关手续。
4.货运计划与单证
船舶代理人在办理货物承运、签发提单的同时还应做好有关货运计划的工作。船舶代理人根据货物承运、签发提单的情况，及时向船公司提供装船货物的资料，
并协助到港船舶及时制订积载计划，通知港口有关部门安排装船作业。
船舶代理人还要缮制各种货运单证。缮制货运单证的原则是：整洁、正确和及时。整洁是指所签发的单证应该自己清晰，尽量避免涂改，计量或计费单位明确，并按照规定分别以大写或小写方式书写文字、数据。正确是指在合理安排货物运输的情况下，单证内容完整无误，并因此要严格按照审核制度对单证进行严格审核。及时是指适应船舶在港进行各项作业的进度，适时地缮制、分送各种货运单证，避免因单证不及时而发生作业中断和待时；对于随船单证，必须在船舶离港前交船长签收。
5.计收运费
船舶代理人根据船公司的委托，可以代收运费，并用托运单证中的运费通知联计算运费，将计算出的运费额数据输人电脑，用以缮制运费账单，收取运费。计算运费的依据是船公司的运价本或船公司通知使用的协议运价。计算的运费数额还应与大副收据或者场站收据记载的内容进行核对。需要时，在核对无误后可以缮制《载货运费清单》（FreightManifest),以该单证代替舱单，并转交班轮公司和各卸货港的代理人。
