应该说，迄今为止，我国集装箱运输的发展程度，沿海地区远远好于内陆地区，水路运输远远好于公路和铁路，集装箱运输在我国中、西部经济相对落后的地区发展得还很差，有很多地区还从来没有过集装箱的踪迹。与发达国家集装箱多式联运纵横交错相比，尚存在非常大的差距。我国各地区集装箱运输发展极不平衡的原因，大约有以下一些方面：
（一）我国各地经济发展极不平衡，导致集装箱运输发展不平衡我国从东到西，经济发展极不平衡。经济发展的差距，·方面导致道路等运输条件的差距，也影响了各地集装箱运输的发展，我国高速公路和高等级公路，至今尚只能较密集地分布在东南沿海发达地区，所以集装箱公路运输的触角，也只能延伸到高速公路与高等级公路能达到的地区，这就限制了集装箱运输的推广和拓展。经济发展的差距i，另一方面也导致了所运货物货种结构的差距，影响了各地集装箱运输发展、经济落后地区所运输货物中迁箱货源（如家用电器、高档消费品、食品等）数量相对较少，而原料、矿产、低档生活资料、上产等相对较多，这也制约了集装箱运输的发展。另外，开展集装箱运输需要大量的基础设施投资，由于缺乏投资能力，经济落后地区就难以形成集装箱运输或接卸能力。
（二）由于种种条件的制约，集装箱运输的优势无法发挥，所以缺乏开展集装箱运输的积极性
集装箱运输高效的优势表现在它是一种“门到门”运输。我国有很多地区集疏运能力差，集装箱根本不可能运到"门"，只能中途拆箱，那么"门到门"运输的优势就无法发挥。其所形成的问题是：货物采用集装箱运输方式后，其运输成本反而大幅上升，所以导致企业对采用集装箱方式运输积极性不高。
（三）集装箱管理的专业人员缺乏，难以形成一支专业管理力量集装箱运输是一种高度标准化、国际化的运输方式，严格按国际惯例进行运输组织。各种单证与国际接轨，适用法律、法规也与国际接轨，采用费用计算方式、保险方式，均按国际惯例办事，与我国传统运输、仓储等做法有一定的距离。所以，开展集装箱水路运输和内陆多式联运，不能简单依靠原来做件杂货运输、仓储的人员与队伍改行，而必须培训建设一支新的专业管理力量。由于集装箱运输的信息管理高度计算机化、国际化，所以这支专业管理队伍的素质要求相应较高，要在短期内形成专业管理队伍也有 定困难。
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