集装箱运输扩大了运输单元，规范了单元尺寸，使得货物的装卸、移动、搬运容易实现机械化、自动化，提高了货物的装卸效率、码头使用效率，扩大了港口的吞吐能力，也减轻了劳动强度。而这种单元又具有一定的规格和强度，集装箱运输具有件杂货运输无法相比的优越性。它在短短的二十多年间，就基本取代了件杂货班轮运输。主要优点归纳如下：
1.提高装卸效率，减轻劳动强度，提高港口吞吐能力。
2.提高货物运输质量，减少了货损货差现象。在采用集装箱运输时，可以在工厂、仓库、场地或集装箱货运站直接将货物装进这种强度较高、水密性较好的集装箱内，箱体对货物进行保护，货物在搬运、移动和装卸过程中不易损坏，不怕风吹雨淋，装箱后铅封，途中丢失的可能性大大降低，货物完好率大大提高。
3.缩短货物在途时间，加速车船的周转，降低营运成本。由于集装箱交接方式多采用“堆场到堆场（CYtoCY>”的方武，以及集装箱号的唯一性，给港口和堆场的机械化、自动化、标准化创造了条件。标准货物单元使装卸搬运动作变得规范、简洁，使集装箱从堆场发放空箱开始，到装箱、重箱进港、落箱至泊位、移动泊位到上船，每个环节都充分发挥装卸设备、搬运设备的能力，实现机械化作业。
4.有利于组织多种运输方式的联合运输。集装箱班轮运输作为一种标准运输单元的出现，使运输工具运载尺寸向统一的满足集装箱运输需要的方向发展，标准化集装箱设计使运输工具之间的换装衔接变得更加便利，这样有利于组织多种运输方式的联合运输，如海空联运、陆海联运、海铁联运等，促进了运输大系统的合理化。另外，集装箱运输与托盘及其他集装单元相结合，使得货物的管理、运输、仓储、分送等的机械化作业效率提高，经济成本降低。
5.推动包装的标准化。集装箱作为一种国际性、统一性的大型标准化运输设备，它的使用和发展直接规范了一大批商品的标准化，在我国有许多包装标准都与集装箱的标准相适应。
