进出境检验检疫的工作成果主要表现为检验检疫机构出具的各种结果单、证书、证单，一般称之为商检证书或检验检疫证书。检验检疫结果单、证书、证单在港口物流中相当重要，它具有以下7方面的作用。
1.进出境货物通关的重要凭证。如出境货物通关单、人境货物通关单、品质证书、植检证书、兽医证书、健康证书、熏蒸消毒证书等都是进出境货物通关的重要凭证。我国对需法定检验检疫的进出口商品，海关在执行监管时凭商检证书或检验检疫机构在有关单证上签发的放行章验放，否则不予验放。许多国家的政府与我国一样，为了维护本国的政治经济利益，对某些进出口商品的品质、数量、包装、卫生、安全、检验制定了严格的法律法规，在有关货物进出口时，必须由当事人提交检验检疫机构符合规定的检验证书和有关证明手续，海关当局才准予进出口。出人境检验检疫机构签发的兽医证书、卫生证书、检疫证书、原产地证书等，是进口国海关和卫生检验部门准予进口的有效文件证明。
2.作为买卖双方结算货款的主要依据。譬如在买卖铬矿石、铁矿石时，尽管合同中订有质量和规格，但最终结算要以检验证书中验明的含铬（Gr)量、含铁量确定等级和计价标准。买卖煤炭、棉花时要依据商检证书合理计算水分含量，并以实际衡量货物吨位后确定的重量为依据来计算货物交接重量及费用。此时，检验证书是银行最后付款结算时的必需文件，并通常被写人合同或信用证条款中。总之，检验部门出具的品质证书、重量或数量证书是买卖双方最终结算货款的重要依据，凭检验证书中确定的货物等级、规格、重量、数量计算货款，是被买卖双方都接受的合理公正的结算方式。
3.计算运输、仓储等费用的重要依据。检验中货载衡量工作所确定的货物重量或体积（尺码吨），是托运人和承运人之间计算运费的有效证件，也是港口仓储部门计算仓租、装卸、理货等费用的有效文件。
4.办理索赔的重要依据。检验检疫机构在检验中发现货物品质不良，或数量、重量不符，违反合同有关规定，或者货物发生残损、海事等意外情况时，检验后签发的有关品质、数量、重量、残损的证书是收货人向各有关责任人提出索赔的重要依据。收货人可以依据责任归属，向卖方提出索赔甚至退货，或者向承运人或保险公司等索赔。同时，检验证书也是国内订货部门向外贸经营部门、保险人、承运人及港口装卸部门等责任方索赔，保险公司向被保险人理赔、向责任人追索的重要文件依据。
5.计算关税的依据。检验检疫机构出具的重量、数量证书，具有公正、准确的特点，是海关核查进出口货物时的重要依据之一。残损证书所标明的残损、缺少的货物可以作为向海关申请退税的有效凭证。检验检疫机构作为官方公证机关出具的产地证明书是进口国海关给予差别关税待遇的基本凭证，在我国出口贸易活动中有重要的意义。我国检验检疫机构签发的一般产地证是取得进口国海关给予最惠国关税的证明文件，签发的普惠制原产地证明书是最惠国给予普惠制关税待遇、享受在最惠国关税基础上进一步减少乃至免除关税的最惠待遇的证明文件。
6.证明情况、明确责任的证件。检验检疫机构应申请人申请委托，经检验鉴定后出具的货物积载状况证明、监装证明、监卸证明、集装箱的验箱及拆箱证明，对船舶检验提供的验舱证明、封舱证明、舱口检视证明，对散装液体货物提供的冷藏箱或舱的冷藏温度证明、取样和封样证明等，都是为证明货物在装运和流通过程中的状态和某些环节而提供的，以便证明事实状态，明确有关方面的责任，也是船方和有关方面免责的证明文件。
7.仲裁、诉讼举证的有效文件。在国际贸易中发生争议和纠纷，买卖双方或有关方面协商解决时，商检证书是有效的证明文件。
