(一)银行主导下的代理监管
该运作模式由银行主导，由银行选择供应链中的某些企业开展授信。第三方物流企业作为银行的代理人代为监管在库或在途货物，或进行应收账款确认等操作。在该模式下，物流企业处于相对被动地位，业务种类主要包括：传统货押、保兑仓、先款后货、信用证项下的未来货权质押等。
最受欢迎的保兑仓业务操作中，一般由银行自己指定的物流企业来完成货物的质押监管。物流企业在这一服务过程中，将获得两部分收益：一是物流运营收费，二是货物评估和质押监管收费。由于物流企业成为银行的合作伙伴，将形成竞争对手难以跨越的门槛，并进而打造成物流企业的一种核心竞争力。
(二)基于物流外包的融资
该模式为第三方物流的主业性派生的增值服务，物流企业从物流服务客户的金融需求出发，通过融资解决方案的设计，以客户货物资产的占有为授信支持，向银行申请融资，其中，全程物流融资和融通仓是典型的代表。
全程物流供应链金融模式，是指企业的货物存放于多个仓储节点或处于多个运输过程的情况下，由银行认可的第三方物流企业对上述货物做24小时全流程封闭监管，保证总体价值高于银行授信所要求的最低价值，在完善抵押登记的基础上，银行向企业提供融资。大型企业的物流外包趋势，为全程物流模式创造了市场空间。
融通仓是指第三方物流企业提供的一种金融与物流集成式的创新服务，其主要服务内容包括物流、流通加工、融资、评估、监督、资产处理等。在实践中，融通仓可以通过两种方式进行。
第一种，第三方物流企业设置公共仓库，吸引中小企业的仓储业务，并指定一家存货融资的主办银行，对公共仓库出具的仓单提供便捷的融资，此模式要求第三方物流企业对仓单的真实性和流动性提供担保。第二种，银行直接向第三方物流企业提供授信额度，由第三方物流企业转授信给自己的主业客户，并依托对客户物流的监控，向银行提供有条件或无条件的担保。或者，第三方物流企业获得银行的授信额度后，直接代替客户向上游采购，客户再分次向物流企业购买货物。
(三)物流、金融服务的横向一体化
该模式下，物流和金融服务合二为一，融资所依托的资产担保正是物流业务中的监管货物及其销售回款，而融资的资金来源也部分来源于代收等业务派生的资金沉淀。物流企业不仅为供应链上的企业提供一系列专业的物流服务，还直接为其提供融资。当然，这就需要物流企业有足够的规模和实力，同样要有先进的信息化技术做支撑。
国际快递业巨头UPS在其开展的供应链金融服务中，兼有物流供应商和银行的双重角色。1998年，UPS在美国收购了一家银行，成立了UPS资本公司，为客户提供包括代理收取货款、抵押贷款、设备租赁、国际贸易融资等业务。托收是UPS金融服务的核心。UPS在收货的同时直接给出口商提供预付货款(一般预付原货款的一定比例，剩余部分在买方结算后再支付给买方),货物即是抵押。这样，小型出口商们得到及时的现金流，UPS再通过UPS银行实现与进口商的结算，而货物在UPS手中，也不必担心进口商赖账的风险。对出口企业来说，借用UPS的资金流，货物发出之后立刻就能变现，如果把这笔现金再拿去做其他的流动用途，便能增加资金的周转率。而通过传统的国际贸易电汇或放账交易方式，从出货装箱到真正拿到货款，至少需要45～60天，营运周转的资金压力极其沉重。UPS开展这项服务时，同样有一个资金流动的时间差，即这部分资金在交付前有一个沉淀期。在资金的这个沉淀期内，UPS等于获得了一笔无息贷款。UPS还可用这笔资金从事贷款，而贷款对象仍为UPS的客户或者限于与快递业务相关的主体。这笔资金不仅充当交换的支付功能，具有了资本与资本流动的含义，而且这种资本的流动是紧密地服务于业务链的。
当然，在国内金融业分业经营的背景下，银行与物流的服务功能无法在同一法人主体内合并，这种一体化只能依靠银行和第三方物流业务的紧密对接来达成。
