配送中心的特性或规模不同，其营运涵盖的作业项目和作业流程也不完全相同，但其基本作业流程大致如下。
1.进货
进货作业包括把货品做实体上的接收，从货车上将其货物卸下，并核对该货品的数量及状态(数量检查、品质检查、开箱等),然后记录必要信息或录入计算机。
进货亦即组织货源。其方式有两种：(1)订货或购货(表现为配送主体向生产商订购货物，由
后者供货);(2)集货或接货(表现为配送主体收集货物，或者接收用户所订购的货物)。前者的货物所有权(物权)属于配送主体，后者的货物所有权属于用户。
2.搬运
搬运是将不同形态之散装、包装或整体之原料、半成品或成品，在平面或垂直方向加以提起、放下或移动，可能是要运送，也可能是要重新摆置物料，而使货品能适时、适量移至适当的位置或场所存放。在配送中心的每个作业环节都包含着搬运作业。
3.储存
储存即按照用户提供的要求并依据配送计划将购到或收集到的各种货物进行检验，然后分门别类地储存在相应的设施或场地中，以备拣选和配货。它的主要任务是把将来要使用或者要出货的物料做保存，且经常要做库存品的检核控制，储存时要注意充分利用空间，还要注意存货的管理。
储存作业一般都包括这样几道程序：运输→卸货→验收→入库→保管→出库。存储作业依产品性质、形状不同而形式各异。有的是利用仓库进行储存，有的是利用露天场地储存，特殊商品(如液体、气体)则需储存在特制的设备中。
4.盘点
货品因不断的进出库，在长期的累积下库存资料容易与实际数量产生不符，或者有些产品因存放过久、不恰当，致使品质功能受影响，难以满足客户的需求。为了有效控制货品数量，需要对各储存场所进行盘点作业。
5.订单处理
由接到客户订货开始至准备着手拣货之间的作业阶段，称为订单处理，包括有关客户、订单的资料确认、存货查询、单据处理以及出货配发等。
6.拣货
每张客户的订单中都至少包含一项以上的商品，如何将这些不同种类数量的商品由配送中心中取出集中在一起，此即所谓的拣货作业。拣货作业的目的也就在于正确且迅速地集合顾客所订购的商品。
7.补货
补货是在拣货区的存货低于设定标准的情况下，将货物从仓库保管区(Reserve Area)搬运到拣货区(Home Area),并作相应的信息处理的工作。其目的是将正确的产品在正确的时间和正确的地点以正确的数量和最有效的方式送到指定的拣货区。
8.出货
出货作业是衔接拣货作业和送货作业之间的作业环节。它是指拣货作业完成后至配送中心商品装车送达之前需要做的一些辅助性工作。其基本作业内容包括：将拣取完成后的货品按订单或配送路线进行分类，再进行出货检查；将商品装入合适的容器或捆包，做好标识和贴印标签；根据车辆趟次别或厂商别等指示将物品运至出货准备区，最后装车配送。
9.送货
送货是指将被订购之物品，使用卡车从配送中心送至顾客手中的活动。在送货流程中，包括这样几项活动：搬运、配装、运输和交货。其作业程序为：配装→运输→交货。送货是配送的终结，故在送货流程中除了要圆满地完成货物的移交任务以外，还必须及时进行货款(或费用)结算。在送货这道工序中，运输是一项主要的经济活动。据此，在进行送货作业时，选择合理的运输方式和使用先进的运输工具，对于提高送货质量至关重要。就前者而言，应选择“直线运输”、“配载运输"(即充分利用运输工具的载重量和容积，合理安排装载的货物和载运方法的一种运输方式)方式进行作业。
