集装箱装箱单是托运人向承运人提供箱内所装货物的明细清单，也是集装箱船舶进出口报关时向海关提交的载货清单的补充文件资料，是船舶积、配载的依据，是装港、卸港进行集装箱装卸作业编制计划的依据，是发生货损时处理索赔事故的原始依据之一。装箱单的填制数据准确与否与货物能否正常出运、能否正常退税核销有十分重要的关系。
集装箱装箱单有五联，第一联为码头联，第二联为承运人联，第三联为船代联，第四联为发货人联，第五联为装箱人联。整箱货由发货人缮制装箱单，拼箱货由作为装箱人的集装箱货运站缮制装箱单。
集装箱装箱单的流转过程如下：
（1）发货人或装箱人将货物装箱后，依据装箱顺序（由里至外）填制装箱货物的船名/航次、箱号、封号、箱型、箱类、提单号、件数与包装、毛重、尺码、货名和咳头（标志）及其他货运资料。对于特种货物，还应加注特定要求，如对冷藏货物要求注明对箱内温度的要求等。
（2）将集装箱和五联装箱单一起送集装箱堆场或码头。码头或堆场的业务人员在五联单上签收，留下第一、二、三联，将第四、五联退还交集装箱货物的发货人或装箱人保留。
（3）码头或堆场留下的三联中，码头联用以编制装船计划，船代联用以缮制积载计划，承运人联作为处理货损事故的依据。
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