物流成本按物流活动的成本项目，可划分为物流功能成本和存货相关成本。这种分类方式实际上是对传统的物流成本按物流功能分类的细化。传统物流成本可分为运输、仓储、包装、装卸搬运、流通加工、物流信息、物流管理等成本，其中仓储成本是一个“大成本”的概念，既包括真正意义上的仓储运作成本，也包括与存货有关的流动资金占用成本、风险成本和保险成本等，且仅指仓储环节与存货有关的成本支出。现实中，随着业务分工的细化及管理精细化的要求越来越迫切，将与存货流动即与物的流动有关的成本支出从仓储成本中分离出来，使仓储成本和其他物流功能成本意义等同，仅反映在仓储环节所发生的物流运作支出，同时，将与存货有关的物流成本支出单独进行分析和管理，积极探寻加速存货资金周转，减少存货风险损失，从而降低物流总成本，已成为现代物流成本管理的方向和工作着力点。另外，与存货有关的利息支出、风险损失和保险费用支出贯穿于物流活动的全程，而不仅仅发生在仓储环节。基于以上两点，这里将传统意义上的物流成本进行细分，将仓储成本还原为物流运作意义上的仓储成本。
物流功能成本。物流功能成本可分为物流运作成本、物流信息成本和物流管理成本。其中，物流运作成本是指完成商品、物资的流通而发生的费用，可进一步细分为运输成本、仓储成本、包装成本、装卸搬运成本、流通加工成本；物流信息成本是指为完成物流信息的收集、传递和处理等发生的费用支出；物流管理成本是实施物流管理发生的费用支出，既包括物流管理部门，也包括物流作业现场的管理费用支出。
存货相关成本。存货相关成本是指在物流活动过程中发生的与持有存货有关的成本支出，具体分为流动资金占用成本、存货风险成本和存货保险成本。
物流成本按物流活动的成本项目分类，可以了解在物流总成本中物流功能成本和存货相关成本各自所占的比重，明确物流成本改善的取向；同时，可以了解物流功能成本内部不同功能成本的结构，了解各自所承担的物流费用，在横向和纵向的比较分析后，明确降低物流成本的功能环节；另外，还可以了解存货相关成本中流动资金占用成本及存货其他成本所占的比重，促进企业加快存货资金周转速度，减少存货风险损失，探索物流功能活动之外的物流成本降低渠道。
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