具体来看，目前我国跨境电商物流主要存在以下几个方面的问题：
(1)跨境电商相关政策支持不足。近年来，我国政府部门也出台了一系列跨境电商政策。2013年，商务部出台《关于实施支持跨境电子商务零售出口有关政策意见的通知》；2014年，海关总署发布《关于跨境贸易电子商务进出境货物、物品有关监管事宜的公告》；2015年，国务院办公厅发布《关于促进跨境电子商务健康快速发展的指导意见》;2016年，国务院办公厅发布《关于跨境电子商务零售进口税收政策的通知》等。
从国家岀台的这一系列政策来看，我国政府也在积极扶持跨境电商这一新兴产业的发展，在海关、税收、仓储、检验检疫等诸多方面也岀台了相应的政策。但与跨境电商的需求相比，我国在跨境电商扶持政策方面仍存在较大的不足，这使得国内跨境电商平台及物流企业的发展都受到了一定程度的阻碍。
(2)具备跨境电商物流配送能力的企业较少。目前，国内的物流企业中，鲜有能够为跨境电商消费者提供个性化及标准化服务的物流服务商。此外，由于涉及各个国家和地区进岀口贸易政策及市场环境的差异，跨境电商行业还未找到一种应用范围广、低成本、高效率的跨境电商物流运作模式。我国具备跨境电商物流配送能力的企业相对较少，大部分的跨境物流配送都要依赖国际快递公司。庞大的市场需求，仅靠少量的国际快递公司远远不够，在节假日等跨境购物订单爆发期，爆仓、快件损坏及丢失等问题频发，极大地限制了跨境电商产业的进一步发展。
(3)物流基础配套设施相对落后。我国的物流基础配套设施相对落后，物流企业数量多、规模小，未能形成具备较强影响力的产业集群，而且在行业标准的制定上也举步维艰。由于跨境电商物流环节较为复杂、耗费的时间相对较长，为了能够尽可能地缩短运送时长，必然要通过完善的物流基础设施来打造出高度成熟的物流配送体系。我国的物流产业的信息化程度不高、高端物流设备普及率较低等方面的问题，对跨境电商物流产业的发展带来了较大的阻力。
(4)缺乏综合实力强的第三方物流企业。虽然我国的物流企业数量众多，但具备较强综合实力的第三方物流企业却屈指可数。很多物流企业认识到了跨境电商物流市场的广阔发展前景，但由于自身的实力所限，当下也只能专注于国内物流服务。在国际快递服务方面，市场中现有跨境电商物流服务商也只不过将其作为一种普通的快递业务，没有面向跨境电商卖家开发出专业的、全流程的跨境物流服务。目前，能够为我国跨境电商消费者提供跨境物流服务的海内外企业包括：顺丰速运公司、中国邮政速递、联邦快递公司(FedEx)、敦豪速递公司(DHL)、联合包裹服务公司(UPS)、TNT国际快递等。
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