造成货运事故的原因归纳起来有以下九种：①未装船前已受损或已存在潜在的致损因素；②装卸作业中受损；③载运工具不符合受载要求；④船上积载不当；⑤装船后与航途中及卸船前的期间保管不当；⑥自然灾害；⑦其他事故殃及；⑧盗窃；⑨其他。下面我们介绍一下主要的事故原因：
(1)货物积载不当。运输的高效率使集装箱船在港时间大大压缩，目前积载的普遍做法是先由岸方和船方分别做预配，再由船方在装卸时根据实际情况来调整。但集装箱的积载不仅要满足船舶稳性、结构强度的要求，还要考虑装卸次序、集装箱类型、堆装系固以及特定货物的特殊积载要求(如危险品要按照国际危规的要求进行隔离，受热易分解货物要远离热源，易挥发货物需良好的通风等)，加上实际操作中不易兼顾，因而常常导致货运事故的发生。据统计，在所有集装箱货运事故中与积载因素有关的事故占70%以上。全球著名的几大集装箱班轮运输公司如马士基、长荣等都为自己的船队制定了关于集装箱积载的规范条例以预防和减少事故的发生。
(2)船体缺陷。如船体甲板老化锈蚀，在集装箱装卸和运输过程中受到撞击、重压产生裂缝或船舶输油、排水管道渗漏引起货物湿损污损；通风系统不能正常工作而造成货物汗损等。
(3)箱体拼装、管理不当。①箱内货物装载、系固不当，如不相容货物装于一箱；箱内货物超重、超量；固定、衬垫不合要求等。②箱体强度结构缺陷，如箱体锈蚀受压破损。③箱体不适货，如怕潮货使用软顶集装箱装运而造成货物受潮变质。④管货不当，如未对铅封的灭失或箱体破损及时记录；冷藏箱未核对温度设定或未打开箱底排水口以及定期检查其工作情况；货舱通风不利造成货物汗损等。
(4)货物本身原因，如含水量过高及包装不合要求。
(5)恶劣天气、海况的影响。比如，强风暴曾造成一条4800TEU的集装箱船360箱货物全损的重大事故，直接经济损失超过1亿美元。
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