如果仅仅是杀灭被包装物品的细菌，而对与其接触的容器、材料和环境不进行灭菌，依然无法保证被包装物品不被微生物侵扰。因此，无菌包装的包装容器（或材料）还必须不附着微生物，同时具有对气体及水蒸气的阻隔性。包装容器（或材料）的灭菌技术通常有以下几种。
(1) 药物灭菌技术药物灭菌也称化学灭菌，所用的杀菌剂必须杀菌力强，对设备无腐 蚀，杀菌过程中不会生成有害物质，同时在包装材料上残留少量药物。目前最常用的杀菌剂 是过氧化氢，俗称双氧水。用过氧化氢对包装容器（或材料）进行杀菌，是将包装容器（或 材料）在过氧化氢中浸渍，或将过氧化氢喷射在包装容器（或材料）上进行杀菌，然后对它 们进行热辐射，使存留在包装容器（或材料）上的过氧化氢和热空气一起蒸发，分解为无害 的水蒸气和氧。
(2) 紫外线灭菌技术紫外线是一种低能量的电磁辐射，紫外线照射使微生物诱变，致 死的主要原因是胸腺嘧啶的光化学转变，其灭菌效果与紫外线的波长、照射度以及照射时间 有关，波长在265〜266nm为最强。
(3) 微波灭菌技术微波灭菌技术是采用频率为300〜300000MHz微波照射包装材料 或容器，引起物体分子间的摩擦而产生热能杀灭微生物和芽孢的方法。微波杀菌比常规加热 消毒所需温度低，其杀菌机理除热效应外，还有某些非热效应，如光化学效应、电磁共振效 应和均致力效应等，可以方便地用于食品包装的灭菌。微波灭菌时间短、速度快、节约能 源、均匀彻底、便于控制、设备简单、工艺先进。
抗菌包装材料将抗菌剂、除氧剂、除湿剂等通过涂覆、复合、共混等方式同包装 材料混合，制成具有抗菌、抑菌的包装材料。抗菌包装材料按材料的微观尺寸级别分为普通 抗菌包装材料和纳米抗菌包装材料。
无菌包装是一个连续灭菌的过程，从被包装物品的输入，包装容器（或材料）的输人 (或直接成型），被包装物品的充填以及最后的封合、冲切都必须在无菌的环境中进行。因 此，在食品包装行业出现了越来越多的无菌包装系统。如无菌罐装包装系统、塑料瓶无菌包 装系统和塑料袋无菌包装系统。
无菌包装系统主要包括：包装容器输人部位、包装容器的灭菌部位、无菌填充部位、无菌封口部位、包装件的输出部位。
